ان سُكان باقوفا هُم من المسيحيين مثل أشقائهم الكلدان ، وهم من السُكان الأوائل الذين تم تحويلهم الى المسيحية بواسطة القديس توما الرسول وذلك بعد فترة قصيرة من قيامة يسوع المسيح .

ان انتماء الكلدان في الأصل كان الى كنيسة المشرق وفي عام 1552 تم انشطارهُم عنها والتحقوا في شراكة كاملة مع روما حيث تم انشاء آنذاك الكنيسة الكاثوليكية الكلدانية والتي تُسمى ألآن "كنيسة بابل الكلدانية" .

يوجد اليوم في باقوفا كنيسة واحدة بأسم "الشهيد مار كوركيس" ، بُنيت عام 1854 من قبل سكان باقوفا وبمُساعدة اشقائهم القُرويين من القُرى المُجاورة المُحيطة بها ، ابعادها (19 متر × 32 متر) وهي صغيرة نسبياً . تحتوي على 18 نقشاً من النقوش الدينية السريانية ، الأقدم من بينها يعود تأريخه الى عام  1565 ، وتحتوي الكنيسة ايضاً على قطعة فنية ذات منشأ اوروبي للقديس مار كوركيس مع التنين والتي رُسمت في نهاية القرن التاسع عشر .

من المُهم جداً ان نذكر هنا بان باقوفا انجبت العلامة المطران "اوجين منا" ، مؤلف كتاب دليل الراغبين في لُغة الآراميين الذي تم طبعه ونشره عام 1900 ، وأُعيد طبعه عام 1975 بطلب من المُثلث الرحمة ألأب البطريرك مار روفائيل الأول بيداويد ، المطران منا له مُؤلفات رئيسية أُخرى منها : قواعد اللغة الآرامية والقاموس الكلداني العربي والأدب الآرامي ، انتقل المطران منا الى رحمة الله عام 1928 في الموصل .